С «испано-немецкой» кишечной палочки сняли маску

Бактерия, заставившая мусью Онищенко закрыть границы родины для оккупационных европейских овощей, идентифицирована китайскими и немецкими генетиками. В Шеньчжэньском отделении Пекинского института геномики при участии специалистов из медицинского центра Гамбургского университета было проведено секвенирование ДНК новой разновидности кишечной палочки, вызвавшей панику у российских санитарных и прочих властей. Для секвенирования использовалась платформа Ion Torrent производства калифорнийской компании Life Technologies. Секвенирование позволило идентифицировать бактерию как энтерогеморрагическую E. coli с серотипом (типом антигенной структуры) O104 (ранее не отмечавшимся у патогенных разновидностей кишечной палочки).

Вообще-то она красавица. Наша E. coli. (Фото Clouds Hill Imaging Ltd. / Corbis.)

Сравнительный анализ показал 93-процентное сходство ДНК новой бактерии с ДНК энтероаггрегативной E. coli из Центрально-Африканской республики, поражающей исключительно людей и вызывающей диарею. Впрочем, некоторые ДНК-последовательности энтерогеморрагической E. coli O104 обнаруживают сходство с ДНК разновидностей кишечной палочки, вызывающих геморрагический колит и гемолитико-уремический синдром. Эти гены новый штамм кишечной палочки получил в результате горизонтального переноса.

Бактерия E. coli O104:H4 (таково полное название штамма) содержит гены, делающие её резистентной к аминогликозиду, макролидам и антибиотикам бета-лактамного ряда.
Китайские учёные, выложившие текущие результаты своей работы в свободный доступ на FTP, обещают держать мир в курсе через Twitter.